Ciertas observaciones se suponen influenciadas por dos factores diferentes, a y b, admitiendo el primero k niveles diferentes y n el segundo. Para cada una de las k n combinaciones posibles de ambos factores se realiza una única observación, obteniéndose una matriz de resultados de la forma
| ( (y1 1 , | y1 2 , | ... , | y1 n | ), |
| (y2 1 , | y2 2 , | ... , | y2 n | ), |
| ... | ... | ... | ... | |
| (yk 1 , | yk 2 , | ... , | yk n | ) ) |
El modelo que se ajusta es
.
Hipótesis adicionales son:

El modelo propuesto incorpora ciertos parámetros que es necesario estimar:



, cuyo estimador insesgado es la
varianza residual:

Los contrastes de interés se reducen a chequear si realmente las respuestas se ven influenciadas por los factores fila y columna, a y b.
En el primer caso, la hipótesis nula es
H0a: "el efecto fila es nulo: ai= 0, para todo i"frente a la alternativa:
H1a: "alguno de los niveles del efecto fila no es nulo".
El estadístico de contraste es

Por otro lado, para contrastar si existe efecto columna, se plantea la hipótesis nula
H0b: "el efecto columna es nulo: bj= 0, para todo j"frente a la alternativa:
H1b: "alguno de los niveles del efecto columna no es nulo".
El estadístico de contraste en este caso es

Clasificados los pacientes en tres grupos (G1, G2 y G3), se han seleccionado al azar dentro de cada grupo cuatro individuos y se les ha suministrado cuatro medicamentos diferentes (M1, M2, M3 y M4), midiéndose para cada combinación paciente/medicamento cierta variable indicadora de la mejora experimentada por el paciente:
M1 M2 M3 M4 G1 15 18 20 20 G2 10 8 12 15 G3 17 15 20 22 Se quiere saber si los pacientes de cada grupo responden de igual manera a los tratamientos y si existen diferencias entre las efectividades de los medicamentos.
Los coeficientes asociados a los grupos de pacientes son 2.25, -4.75 y 2.5, dando a entender que el grupo G2 parece responder peor durante la experiencia. En cuanto a los medicamentos, los dos primeros son menos efectivos al tener coeficientes negativos (-2.00 y -2.33). Esto sugiere que efectivamente tanto la pertenencia a los grupos de enfermos como el medicamento suministrado actúan sobre la mejora de los pacientes; tal conclusión se ve ratificada por los dos contrastes de nulidad de los factores, ya que ambos rechazan las hipótesis nulas con niveles de significación del 5%.
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